С мoмeнтa вoсстaнoвлeния нeзaвисимoсти Эстoнии, в стрaнe прeoблaдaлa сильнaя эмигрaция, причём  эмигрaция постоянно превышала иммиграцию.

По данным Департамента статистики Эстонии, за последние годы, основная часть иммигрантов были выходцы из таких стран как:  Россия, Украина, Великобритания и Финляндия. Эстонцы предпочитали эмигрировать в такие страны как: Украина, Россия, Финляндия, Великобритания, Ирландия, Германия  и США.

Среди иммигрирующих, за последнее время, в Эстонию 60% составили мужчины, а среди уехавших было наоборот больше женщин чем мужчин, причём покинули Эстонию очень много молодёжи в возрасте 20-30 лет.
За 2010 год Эстонию покинули почти 6000 человек, это на 15% больше чем в прошлом году, при этом количество иммигрантов, по сравнению с 2009 г., снизилось на 25%.

Внутренняя миграция населения, или другими словами смена местожительства в пределах Эстонии, которая выходит за границы одного уезда, города, или волости, осталась на уровне 2009 года. Уезжая за пределы одного уезда, города или волости, 37 500 человек поменяли свое местожительство.

Таллинн был первым в списке позитивного миграционного сальдо (число въехавших превышало число уехавших, население города выросло на 2353 человека), за ним следуют волости Харку и Раэ (население увеличилось на 853 и 442 человека. С самым высоким негативным миграционным сальдо (из города уехало больше жителей, чем в него переехало) оказались Пярну и Тарту.

Направлениями внутренней миграции по прежнему являются пригород, откуда, в свою очередь, уезжают в ближайшие волости. Основным направлением миграции является Таллинн, который уже несколько лет подряд сохраняет свое миграционное сальдо позитивным за счет людей, съезжающихся со всей страны.

Власти Эстонии всерьёз озабочены проблемой эмиграции населения, ведь среди мигрирующих (как внутри страны, так и из нее) больше всего молодёжи в возрасте 20-30 лет и если эмиграция продолжится нынешними темпами, то через 20 лет некому будет платить налоги даже в объеме, позволяющем выплачивать пенсии.